Care ar putea fi problema dacă benzile nu apar în Western Blot?

Care ar putea fi problema dacă benzile nu apar în Western Blot?
Anonim

Răspuns:

Mulți…

Explicaţie:

Există multe motive pentru care benzile nu pot apărea pe un Western blot. Au avut combinații de eșantioane și anticorpi în trecut?

Mai jos sunt doar câteva pe care mă pot gândi în acest moment care ar putea face ca benzile să nu apară:

  1. A transferat proteina din gel? Încercați să colorați membrana cu ceva de genul ponceau S sau amido negru pentru a vedea dacă sunt prezente benzile. Uneori, puteți vedea benzile de proteine de pe membrană umezindu-l și ținându-l sub un unghi față de lumină.

  2. Anticorpul primar funcționează? Aceasta este una dificil de testat și singura modalitate prin care puteți fi este includerea unui control pozitiv în cazul în care știți că aveți proteinele de interes prezente. Dacă aveți o parte din proteina de interes, ați putea încerca să o pătrunzi pe membrana Western blotting (adică nu rulați gelul) și să vedeți dacă obțineți un rezultat dacă procesați membrana ca și cum ar fi o blândă westernă.

  3. Anticorpul secundar recunoaște anticorpul primar? Din nou, unul dur pentru a testa. Despre singurul test pe care îl puteți face este testul la fața locului menționat mai sus la punctul 2.

  4. Sistemul de detectare funcționează? În funcție de metoda de detectare pe care o utilizați, puteți încerca să introduceți o parte din anticorpul secundar pentru a vedea dacă funcționează soluția de detectare și, de asemenea, agentul / enzima de declanșare a anticorpului secundar. Adică, puteți declanșa reacția numai cu anticorpul secundar?

În cele din urmă, ar putea fi la fel de simplă ca una dintre soluțiile utilizate în timpul analizei parcelei să fie făcută incorect. De exemplu, dacă concentrația de sare este greșită în tampon, acest lucru poate determina eliberarea anticorpilor de pe blot. Același lucru s-ar întâmpla și în cazul în care pH-ul tampoanelor nu ar fi corect.

Cea mai "ciudată" cauză pentru un bloc western care nu funcționează pe care l-am experimentat personal a fost când am schimbat furnizorul de lapte praf pe care l-am folosit pentru a bloca membrana. Pulberea de la noul furnizor conține o fosfatazină fosfatrozină care îndepărtează toate grupările fosfat pe care încercam să le detectăm cu anticorpul nostru anti-fosfotirozină.